Pada awalnya Perhimpunan Organisasi Profesi Sosial Ekonomi Pertanian Indonesia terbagi dalam tiga wilayah. Kemudian pada Musyawarah Nasional (MUNAS) ketiga tahun 1993-1995 terbagi menjadi enam wilayah atas rekomendasi dari Ketua Dewan Pengurus Wilayah POPMASEPI. Wilayah 1 terdiri dari Pulau Sumatera, wilayah 2 terdiri dari Banten, Jawa Barat, Kalimantan Barat, dan DKI Jakarta, wilayah 3 terdiri dari Jawa Tengah dan Yogyakarta, Wilayah 4 terdiri dari Jawa Timur, Nusa Tenggara Timur, Nusa Tenggara Barat, dan Bali, wilayah 5 terdiri dari Pulau Sulawesi, Maluku Utara, Maluku Selatan, dan Papua, terakhir wilayah 6 terdiri dari Kalimantan Selatan, Kalimantan Timur dan Kalimantan Tengah.

​

Dewan Pengurus Wilayah VI pada saat itu beranggotakan dari Universitas Mulawarman, dan Universitas Lambung Mangkurat sebagai anggota tetap, sedangkan anggota sementara pada saat itu dari Universitas Kutai Kartanegara dan Universitas Palangkaraya. Pada Tahun 2001 dibentuklah pengurus untuk wilayah 6 yang diwakili oleh Mahasiswa dari Universitas Mulawarman, Universitas Palangkaraya dan Universitas Lambung Mangkurat yaitu Tetty Wijayanti, S.P., M.P, Firda Juita, S.P., M.P, Mursidah, S.P., M.M dan Achmad Zaini, S.P., M, Si sebagai pengurus Dewan Pengurus Wilayah VI POPMASEPI (sekarang dosen di Universitas Mulawarman).

​

Kemudian Dewan Pengurus Wilayah VI POPMASEPI mengalami ketidakaktifan kepengurusan selama beberapa tahun karena susahnya mencari kader POPMASEPI di wilayah VI yang loyal terhadap Dewan Pengurus Wilayah VI POPMASEPI serta krisisnya regenerasi di wilayah VI. Dan kembali aktif lagi pada tahun 2009 dengan diadakannya Musyawarah Wilayah Luar Biasa (MUSWILUB) di Universitas Mulawarman dan terpilihnya saudara Muhammad Oktavia Nur atau yang dikenal dengan nama saudara Ozan mahasiswa dari Universitas Mulawarman sebagai ketua wilayah periode 2010-2012. Selanjutnya dilaksanakannya Musyawarah Kerja Wilayah (MUKERWIL) dan dilantiknya saudara Ozan sebagai Ketua Dewan Pengurus Wilayah VI POPMASEPI di Universitas Kutai Kartanegara yang dihadiri oleh delegasi dari Universitas Lambung Mangkurat dan Universitas Mulawarman.

​

Kegiatan yang dilaksanakan pada saat kepengurusan saudara Ozan yaitu pada tahun 2009 terlaksananya Musyawarah Kerja Wilayah (MUKERWIL) di Universitas Kutai Kartanegara. Latihan Kepemimpinan dan Manajemen Mahasiswa (LKMM) di Universitas Lambung Mangkurat, namun karena terkendalanya legalitas atau perizinan pada saat itu sehingga Latihan Kepemimpinan dan Manajemen Mahasiswa (LKMM) yang direncanakan akan dilaksanakan di Universitas Lambung Mangkurat tidak terlaksana. Kegiatan selanjutnya yaitu Pekan Keprofesian Pengabdian Popmasepi (PKPP) BINA DESA di Universitas Kutai Kartanegara, sama halnya dengan Latihan Kepemimpinan dan Manajemen Mahasiswa (LKMM) di Universitas Lambung Mangkurat. Pekan Keprofesian Pengabdian Popmasepi (PKPP) BINA DESA yang direncanakan akan dilaksanakan di Universitas Kutai Kartanegara juga tidak terlaksana karena terkendala di legalitas/perizinan. Selanjutnya Musyawarah Wilayah (MUSWIL) yang direncanakan akan dilaksanakan di Universitas Borneo Tarakan juga tidak mendapatkan perizinan, sehingga Musyawarah Wilayah (MUSWIL) juga tidak terlaksana.

​